Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PmpcbQ9CXT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PmpcbQ9CXT8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PmpcbQ9CXT8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms