Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gje1Q9CX92 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gje1Q9CX92 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gje1Q9CX92 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms