Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm8aQ9CWZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbm8aQ9CWZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm8aQ9CWZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms