Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx47Q9CWX9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx47Q9CWX9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx47Q9CWX9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms