Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd4Q9CWX4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd4Q9CWX4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms