Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cxxc1Q9CWW7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxxc1Q9CWW7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms