Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BccipQ9CWI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BccipQ9CWI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BccipQ9CWI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BccipQ9CWI3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms