Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH5

Trmt11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt11Q9CWH5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt11Q9CWH5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt11Q9CWH5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt11Q9CWH5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms