Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms