Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pard3bQ9CSB4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pard3bQ9CSB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms