Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl28Q9CR40 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms