Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn1Q9CR36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms