Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc2Q9CQP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc2Q9CQP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms