Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufb9Q9CQJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufb9Q9CQJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufb9Q9CQJ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms