Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efcab2Q9CQ46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab2Q9CQ46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab2Q9CQ46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab2Q9CQ46 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Efcab2Q9CQ46 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Efcab2Q9CQ46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Efcab2Q9CQ46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efcab2Q9CQ46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Efcab2Q9CQ46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Efcab2Q9CQ46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Efcab2Q9CQ46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab2Q9CQ46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efcab2Q9CQ46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms