Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl49Q9CQ40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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