Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc198Q9CPZ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc198Q9CPZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms