Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rims1Q99NE5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rims1Q99NE5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims1Q99NE5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rims1Q99NE5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims1Q99NE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms