Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkd1Q99MH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkd1Q99MH6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkd1Q99MH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkd1Q99MH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms