Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atp1b4Q99ME6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Atp1b4Q99ME6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Atp1b4Q99ME6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms