Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dctn2Q99KJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dctn2Q99KJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dctn2Q99KJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dctn2Q99KJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms