Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smarcd2Q99JR8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smarcd2Q99JR8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms