Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctu1Q99J10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ctu1Q99J10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctu1Q99J10 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctu1Q99J10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms