Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn16Q925N4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn16Q925N4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms