Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim59Q922Y2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim59Q922Y2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim59Q922Y2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms