Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3b3Q921M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sf3b3Q921M3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b3Q921M3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms