Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt16hQ920B9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt16hQ920B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt16hQ920B9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Supt16hQ920B9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms