Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx18Q91ZR2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms