Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh2b1Q91ZM2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh2b1Q91ZM2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh2b1Q91ZM2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms