Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtsqQ91ZF4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtsqQ91ZF4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms