Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf6Q91YR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms