Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha2Q91Y17 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha2Q91Y17 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha2Q91Y17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms