Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ4

Pcdhb6, Protocadherin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb6Q91XZ4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb6Q91XZ4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb6Q91XZ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb6Q91XZ4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb6Q91XZ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb6Q91XZ4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb6Q91XZ4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms