Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klc3Q91W40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klc3Q91W40 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Klc3Q91W40 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klc3Q91W40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms