Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ciz1Q8VEH2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ciz1Q8VEH2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciz1Q8VEH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ciz1Q8VEH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ciz1Q8VEH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms