Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDW4

Ube2w, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2wQ8VDW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2wQ8VDW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2wQ8VDW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2wQ8VDW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms