Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy2Q8R4C2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy2Q8R4C2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy2Q8R4C2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms