Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Nlrp3Q8R4B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp3Q8R4B8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nlrp3Q8R4B8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp3Q8R4B8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp3Q8R4B8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp3Q8R4B8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp3Q8R4B8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms