Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf3c5Q8R2T8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gtf3c5Q8R2T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gtf3c5Q8R2T8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 658.8 ms