Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim29Q8R2Q0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim29Q8R2Q0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim29Q8R2Q0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms