Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga1Q8R0H9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gga1Q8R0H9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga1Q8R0H9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga1Q8R0H9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms