Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nsl1Q8K305 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsl1Q8K305 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms