Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms