Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FntbQ8K2I1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FntbQ8K2I1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FntbQ8K2I1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FntbQ8K2I1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms