Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Colgalt1Q8K297 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Colgalt1Q8K297 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Colgalt1Q8K297 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Colgalt1Q8K297 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms