Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf3c1Q8K284 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf3c1Q8K284 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf3c1Q8K284 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c1Q8K284 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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