Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FgbQ8K0E8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FgbQ8K0E8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FgbQ8K0E8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FgbQ8K0E8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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