Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LgsnQ8CIX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LgsnQ8CIX8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LgsnQ8CIX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms