Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG3

Kdm1b, Lysine-specific histone demethylase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm1bQ8CIG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1bQ8CIG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1bQ8CIG3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm1bQ8CIG3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm1bQ8CIG3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms