Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9030612E09RikQ8CE20 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
9030612E09RikQ8CE20 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
9030612E09RikQ8CE20 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms